Το εγκεφαλονωτιαίο υγρό το λαμβάνεται μετά από οσφυονωτιαία παρακέντηση στο σπονδυλικό σωλήνα, σε μέρη που δεν υπάρχει κίνδυνος τρώσης του νωτιαίου μυελού και κυρίως γίνονται βακτηριολογικές και βιοχημικές αναλύσεις προκειμένου να πιστοποιηθεί η ύπαρξη κάποιου κυτταρικού όγκου,φυμώματος, βακτηριδιακής λοίμωξης.
Κυρίως όμως μιας σκλήρυνσης κατά πλάκας, πιστοποιώντας την ύπαρξη ολιγοκλωνικών ζωνών, μια παλιάς σύφιλης ή ακόμα Aidsή παράμετροι της λοίμωξης αυτής.